Colabora en proyectos educativos con diversas entidades, como el Instituto de Astrofísica de Canarias desde el año 2002, actualmente colaborador del proyecto TAD (Telescopio Abierto de Divulgación), un telescopio robótico que se puede controlar mediante un navegador de Internet.
Colabora con el grupo Shelios Expediciones Científicas (www.shelios.com) y el proyecto educativo Ruta de las Estrellas (www.rutaestrellas.com), que realizan viajes por todo el globo con motivo de grandes eventos celestes como eclipses o auroras polares. Juan Carlos Casado ha observado más de 40 eclipses de todos los tipos, entre ellos 12 totales de Sol, desde lugares tan distantes como la isla de Pascua o la Antártida.
En 1997 obtuvo su primera APOD ( Astronomy Picture of the Day) por la NASA, siendo actualmente el español más reconocido con 29 APODs publicadas.
Ha publicado imágenes y artículos en diferentes medios de varios países en publicaciones como La Vanguardia, Descobrir Catalunya, Conocer, Natura, Foto-Vídeo, Ciel et Espace (Francia), Astronomy BBC (Reino Unido), National Geographic, Sky & Telescope, Astronomy, Nature (EEUU), Kvant (Diamarca), Astroarts (Japón), televisiones: TVE, NBC, BBC, numerosas webs, así como en diferentes libros de diversos países.
Ha colaborado con sus imágenes con entidades como la National Academy of Sciences (EEUU), ESA, Instituto de Astrofísica de París, universidades como Dakota del Norte, Colorado, Suffolk, Yale (EEUU) y en museos de ciencia y planetarios de Pamplona, Madrid, Copenhaguen (Dinamarca), Montreal (Canadá), el Observatorio-Planetario Nicholas Copernicus (Brno, República Checa), Nehru, Nueva Delhi (India), Armagh (Reino Unidot), Max Schreier (La Paz, Bolivia), el observatorio Lowell y el Museo de Historia Natural de Nueva York (USA).
Actualmente es coordinador de portal web tierrayestrellas.com y miembro del equipo internacional del proyecto TWAN (www.twanight.org), reconocido por la UNESCO, que agrupa a algunos de los mejores astrofotógrafos del mundo.